Indicatie voor systemische behandeling volgens NHG Standaard:

- furunkel die gepaard gaat met algemene malaise en koorts
- furunkel boven de onderste kaaklijn
- verhoogd risico op gecompliceerd beloop door een verminderde afweer: onder andere onbehandelde hiv-infectie, multipele sclerose, transplantatie (orgaan/stamcel/beenmerg) in verleden, (hematologische) maligniteit, asplenie, medicatie (immunosuppressiva, (soms tot een jaar na gebruik van) cytostatica en intraveneus drugsgebruik.
- verhoogd risico op endocarditis: voorgeschiedenis van endocarditis, hartklepprothesen of aangeboren hartklepafwijkingen.
- verhoogd risico op infectie van een gewrichtsprothese: een gewrichtsprothese < 2 jaar oud of een gewrichtsprothese > 2 jaar in combinatie met een voorgeschiedenis van een geïnfecteerde gewrichtsprothese, reumatische gewrichtsaandoening of hemofilie
- bij niet-genezende furunkel

Bij recidiverende furunculose: overweeg dragerschapsbehandeling. Zie hiervoor het advies onder MRSA dragerschap.